1. Zastosowanie analiz omicznych i badań mikrobiologicznych w poszukiwaniu biomarkerów predykcyjnych sepsy u pacjentów z ZUM oraz ocena czynników wpływających na jej rozwój.
  2. Rola profili oporności drobnoustrojów i zmian omicznych w patogenezie sepsy oraz ich znaczenie diagnostyczne i prognostyczne.
  3. Zależność między składem mikrobiologicznym mleka kobiecego a kształtowaniem się mikrobioty noworodków – analiza jakościowa i ilościowa.
  4. Zastosowanie cyfrowej PCR (digital PCR) w ilościowej analizie wybranych bakterii mikrobioty ludzkiej. 

Wykorzystywane techniki molekularne: PCR, real-time PCR, digital PCR, sekwencjonowanie w nanoporze oraz techniki OMICZNE - proteomika, metabolomika we współpracy z Gdańskim Uniwersytetem Medycznym.